1953年成立鄭州市隔離醫院，1954年更名為鄭州市傳染病醫院，1985年更名為鄭州市第六人民醫院。2001年與鄭州市結核病防治所合并。2006年被原省衛生廳批準為“河南省傳染病醫院”。

經過68年的發展，醫院已發展成為一所集醫療、教學、科研、預防、保健、康復于一體的三級甲等傳染病醫院。

醫院占地4.8萬平方米，建筑面積7.7萬平方米，核定床位1460張，實際開放床位1180張。

全院現有在崗職工1778人，衛生技術人員1491人，占總人數的83.86%，其中注冊護士896人，占衛生技術人員總數的60.10%。高級職稱165人，碩、博研究生232人，國家級專家4人，國家級專業委員會副主任委員7人，省市學會主任委員11人。

學科建設科學規范，設置臨床科室48個，醫技科室17個。近年來，醫院提出“精?？?、強綜合，堅持防治一體”的辦院方針，形成了以艾滋病、結核病、肝病和感染性疾病四大學科為基礎，內科、外科、婦產科、兒科、重癥醫學科等為一體的傳染病綜合救治體系，收治全部法定傳染病，HIV母嬰阻斷率達到100%，實現了河南省艾滋病心臟手術零的突破，艾滋病患者來自全國各地，傳染病綜合救治立足河南，面向中部六省、輻射全國。

醫院目前擁有省級重點培育學科、省級中醫重點?？?、省級醫學重點實驗室、省級科研平臺等14個。
醫院配備有1.5T磁共振系統、64排螺旋CT、移動方艙CT、數字減影血管造影機、人工肝分子吸附循環系統、全自動快速微生物質譜鑒定儀、全自動病原體快速檢測系統、流式細胞儀、體外循環機、分枝桿菌快培檢測系統、體外膜肺氧合（ECMO）等先進診療設備。